| 2018 | 從耶穌會的傳教士漢學到法國學院漢學 | 潘鳳娟 | 2018-08~2021-07 | 科技部 |
| 2018 | 安岡正篤在戰前與戰後的陽明學與日本精神之轉化 | 張崑將 | 2018-08~2019-07 | 科技部 |
| 2017 | 東亞戰爭中的武士道與佛教 | 張崑將 | 2017-08~2018-07 | 科技部 |
| 2016 | 龍華民〈論中國宗教的幾點問題〉：不同稿本與印本的比較分析 | 潘鳳娟 | 2016-08~2018-07 | 科技部 |
| 2015 | 修養與尚武之間：明治維新以後的陽明學與武士道 | 張崑將 | 2015-08~2017-07 | 科技部 |
| 2014 | 晉宋文學中的離散書寫（II） | 王美秀 | 2014-08~2015-07 | 國科會 |
| 2013 | 傳教士、老子、漢學家:十八～十九世紀西方的《道德經》翻譯 | 潘鳳娟 | 2013-08~2016-07 | 國科會 |
| 2013 | 晉宋文學中的離散書寫（I） | | 2013-08~2014-07 | 國科會 |
| 2013 | 當代新儒家熊十力的儒家式生態空間論 | 潘朝陽 | 2013-08~2014-07 | 國科會 |
| 2013 | 武士精神的近代轉化與日本精神的建構 | 張崑將 | 2013-08~2014-07 | 國科會 |
| 2012 | 從前近代到近代日韓儒耶之會通與諍辯之比較 | 張崑將 | 2012-08~2013-07 | 國科會 |
| 2012 | 韓國傳統與近現代的儒家倫常與宗教對話 | 張崑將 | 2012-04~2012-12 | 本校邁向頂尖大學計畫研究計畫 |
| 2012 | 建構邊疆與想像南方—《水經注》的空間論述(II) | 王美秀 | 2012-08~2013-07 | 國科會 |
| 2012 | The Transmission of Aristotelianism and Scientific Thought to China through the Chinese Works of Jes | 潘鳳娟共同主持人/ 主持人為Elisabetta Corsi教授 | 2012-01~2012-12 | 義大利教育部 |
| 2011 | 聖嚴法師旅行書寫中的歷史特質研究 | 王美秀 | 2011-05~2012-04 | 聖嚴教育基金會 |
| 2011 | 建構邊疆與想像南方—《水經注》的空間論述(I) | 王美秀 | 2011-08~2012-07 | 國科會 |
| 2011 | 日本女武士道的轉型：歷史與現代 | 張崑將 | 2011-08~2012-07 | 國科會 |
| 2011 | 儒家倫常在東亞：詮釋、衝突與融合 | 張崑將 | 2011-10~2012-03 | 本校邁向頂尖大學計畫研究計畫 |
| 2010 | 知識展現對地景再現的作用——《水經注》研究的一個面向 | 王美秀 | 2011-02~2012-02 | 國立臺灣師範大學 |
| 2010 | 《中國叢報》、耶穌會、歐美漢學：重新閱讀與書寫傳教士與近代中西交流史 | 潘鳳娟 | 2010-08~2013-07 | 國科會 |
| 2009 | 對話與辯證——聖嚴法師的旅行書寫與法顯《佛國記》之比較研究 | 王美秀 | 2009-08~2010-07 | 聖嚴教育基金會 |
| 2009 | 明治維新後至戰前的日本基督教徒之武士道倫理觀 | 張崑將 | 2009-08~2011-07 | 國科會 |
| 2009 | 孝道、帝國文獻與翻譯：法籍耶穌會士韓國英(Pierre-Martial Cibot, 1727-1780 )與清初孝道文獻的西傳 | 潘鳳娟 | 2009-08~2010-07 | 國科會 |
| 2008 | 南朝末期羈北文士的邊塞書寫——以詩賦為中心的考察 | 王美秀 | 2008-08~2009-07 | 國科會 |
| 2008 | 明儒的人觀與我觀：王陽明與陽明學派 | 張崑將 | 2008-01~2011-07 | 臺灣大學優勢重點領域拔尖計畫，楊國樞教授總主持「華人的人觀與我觀：跨學科與跨文化研究」之子計畫 |
| 2008 | 譯釋之間：衛方濟(François Noël, 1651-1729)的經典翻譯與中國書寫 | 潘鳳娟 | 2008-08~2009-10 | 國科會 |
| 2008 | 衛方濟與理雅各《孝經》翻譯比較研究 | 潘鳳娟 | 2008-01~2009-03 | 台師大研發處 |
| 2007 | 日本武士道的宗教倫理與現象 | 張崑將 | 2007-08~2009-07 | 國科會 |
| 2006 | 回首江南——江南記憶對顏之推身分建構的意義 | 王美秀 | 2006-08~2007-07 | 國科會 |
| 2006 | 千年之旅——法顯《佛國記》及其英譯本研究 | 王美秀 | 2006-01~2006-07 | 國立雲林科技大學 |
| 2006 | 日本幕末陽明學者對陽明後學之評論 | 張崑將 | 2006-08~2007-07 | 國科會 |
| 2005 | 記憶與遺忘——顏之推的祖先溯源方式研究 | 王美秀 | 2005-01~2005-07 | 國立雲林科技大學 |
| 2005 | 近代中日陽明學的發展關係與特質 | 張崑將 | 2005-08~2006-07 | 國科會 |
| 2004 | 日本德川末期陽明學與石門心學的發展關係及其作用 | 張崑將 | 2004-08~2005-07 | 國科會 |
| 114 | 衛方濟、陳澔、禮儀之爭── 以《中國禮儀歷史紀錄》、《中國哲學三論》與《禮記集說》為中心 | 潘鳳娟 | 2025-08~2028-08 | 國科會 |
| 113 | 想像的他者：全球南方下的新加坡族裔互文性研究--超越“華人性”？：新加坡國家政策下的華族、印度族的宗教場域及其文化混融 | 江柏煒 | 2024-08~2025-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 113 | 韌性社會與跨域治理：馬祖戰地／後戰地社會的轉型及創新(3/3) | 江柏煒 | 2024-07~2025-06 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 113 | 113年大學社會責任實踐計畫-全球在地取向的金門地方創生與青創培力計畫 | 江柏煒 | 2024-01~2024-12 | 教育部 |
| 113 | 2024桃園閩南文化國際論壇 | 江柏煒 | 2024-01~2024-08 | 桃園市政府文化局 |
| 113 | 金門縣文化景觀「太武山文化景觀」調查研究及保存維護計畫 | 江柏煒 | 2024-02~ | 金門縣文化局 |
| 113 | 金門國家公園成立30周年國際學術研討會 | 江柏煒 | 2024-06~ | 內政部國家公園署金門國家公園管理處 |
| 113 | 金門國家公園傳統聚落保存策略及整體發展研究案 | 江柏煒 | 2024-09~ | 內政部國家公園署金門國家公園管理處 |
| 112 | 因地制宜、與時俱進：透過機器學習與空間分析探討台灣金融分支機構的動態變遷及永續發展，2005-2022 | 林昌平 | 2023-08~2024-07 | 國家科學及技術委員會 |
| 112 | 反思華人性：臺灣與新加坡的家國想像與敘事空間--想像的家園、意外的國度：臺灣與新加坡華人社會的家國敘事與文化景觀之比較 | 江柏煒 | 2023-08~2024-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 112 | 韌性社會與跨域治理：馬祖戰地／後戰地社會的轉型及創新(2/3) | 江柏煒 | 2023-07~2024-08 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 112 | 112年大學社會責任實踐計畫-全球在地取向的金門地方創生與青創培力計畫 | 江柏煒 | 2023-01~2023-12 | 教育部 |
| 112 | 教育部補助112年度人文社會與產業實務創新鏈結計畫第零期B類【風土經濟與地方創生之鏈結實踐：數位技術及博物館系統為中心的培力計畫】 | 江柏煒 | 2023-02~2023-07 | 教育部 |
| 112 | 金門歷史民俗博物館展示規劃研究專案 | 江柏煒 | 2023-07~2024-01 | 金門縣文化園區管理所 |
| 112 | 金門國家公園戰地文化景觀資源價值評估與分級治理先期規劃 | 江柏煒 | 2023-01~2024-12 | 內政部國家公園署金門國家公園管理處 |
| 112 | 金門縣史蹟「明清金門城遺跡」保存維護計畫 | 江柏煒 | 2023-01~2024-06 | 金門縣文化局 |
| 112 | 112年桃園閩南文化論文徵件委託辦理案 | 江柏煒 | 2023-10~ | 桃園市政府文化局 |
| 112 | 金門縣博物館與地方文化館運籌機制計畫 | 江柏煒 | 2023-08~2024-05 | 金門縣文化局 |
| 111 | 記憶先輩、想像我族，及其空間化隱喻--新、馬、泰華人傳記之比較研究 | 張碧君 | 2020-08~2021-07 | 科技部 |
| 111 | 18-19世紀西方的《道德經》翻譯(專書寫作計畫)新制三年期 | 潘鳳娟 | 2022-08~2026-01 | 國科會（科技部） |
| 111 | 日本戰前「批判禪學」的論諍：以臨濟宗與曹洞宗為中心的考察（三年期） | 張崑將 | 2022-08~2023-07 | 國科會 |
| 111 | 危脆視野中的東南亞：全球化閾限的威脅與契機--新加坡棋樟山（聖約翰島）的華人社群記憶與地景變遷：移民路上的危脆、隔離與檢疫 | 江柏煒 | 2022-08~2023-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 111 | 韌性社會與跨域治理：馬祖戰地／後戰地社會的轉型及創新(1/3) | 江柏煒 | 2022-07~2023-06 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 111 | 111年僑務學術研討會 | 江柏煒 | 2022-01~2022-12 | 中華民國僑務委員會 |
| 111 | 僑務政策與國家發展課程 | 江柏煒 | 2023-02~2022-12 | 中華民國僑務委員會 |
| 111 | 僑務政策與國家發展課程 | 江柏煒 | 2022-02~2022-12 | 中華民國僑務委員會 |
| 111 | 金門縣110-111年度博物館與地方文化館運籌機制計畫 | 江柏煒 | 2022-01~2022-11 | 金門縣文化局 |
| 111 | 2022金門學國際學術研討會 | 江柏煒 | 2022-07~2023-06 | 金門縣文化局 |
| 111 | 金門國家公園古寧頭區戰地文化景觀資源價值評估與分級治理先期規劃 | 江柏煒 | 2022-02~2022-11 | 內政部國家公園署金門國家公園管理處 |
| 111 | 111年金門原鄉再連結教育與交流計畫 | 江柏煒 | 2022-06~2022-12 | 金門縣政府 |
| 110 | 18-19世紀西方傳教士與中國禮經的翻譯與詮釋 | 潘鳳娟 | 2021-08~2022-07 | 科技部 |
| 110 | 社群政治、文化景觀與華人義山：馬來西亞雪蘭莪州巴生福建義山的案例分析 | 江柏煒 | 2021-08~2023-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 110 | 2021閩南文化國際學術研討會 | 江柏煒 | 2021-04~2022-04 | 金門縣文化局 |
| 110 | 金門文化園區轉型規劃暨發展運籌–金門博物館典藏制度建置與文物管理輔導計畫 | 江柏煒 | 2021-07~2022-01 | 金門縣文化園區管理所 |
| 110 | 金門原鄉再連結教育與交流計畫 | 江柏煒 | 2021-08~2021-12 | 金門縣政府 |
| 110 | 馬祖文化資產保存策略規劃與行動方案–莒光、南竿、北竿戰地文化景觀保存維護計畫 | 江柏煒 | 2021-08~2022-12 | 連江縣政府 |
| 110 | 東引中路文化資源盤點及保存再利用計畫 | 江柏煒 | 2021-09~2022-06 | 連江縣政府 |
| 109 | 以時空為經緯、田野為彌綸：由金門移民網絡探討臺商與東南亞海外華人、華商與會館之再連結 | 林昌平 | 2020-08~2021-07 | 科技部研究計畫 |
| 109 | 金門縣定古蹟珠山下三落修復及再利用計畫 | 江柏煒 | 2020-05~2021-06 | 金門縣文化局 |
| 109 | 金門縣108-109年度「博物館與地方文化館發展運籌機制」計畫擴充案 | 江柏煒 | 2020-06~2021-04 | 金門縣文化局 |
| 109 | 金門戰地文化景觀保存維護與發展綱要計畫 | 江柏煒 | 2020-09~2021-08 | 金門縣政府 |
| 109 | 109「冷戰‧島嶼」：連江縣再造歷史現場專案執行總顧問計畫 | 江柏煒 | 2020-07~2020-12 | 連江縣政府 |
| 109 | 世遺文本增補金馬共同論述部分與修訂計畫 | 江柏煒 | 2020-05~2020-11 | 連江縣政府 |
| 108 | 跨域學習：由社會科學量化研究培養學生資料識讀與溝通思維 | 林昌平 | 2019-08~2020-07 | 教育部教學實踐研究計畫 |
| 108 | 跨境（國）社區：烈嶼與汶萊的移民記憶與社會網絡 | 江柏煒 | 2019-08~2020-12 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 107 | 族群政治與記憶空間：馬來西亞華人空間的集體意義 | 張碧君 | 2019-08~2021-01 | 科技部 |
| 107 | 「再造僑鄉」中的跨境／跨國網絡、記憶政治及地方策略： 金門與廈門海滄的比較研究（1980年代迄今） | 江柏煒 | 2018-08~2019-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 106 | 在西進與南向之間：由空間觀點探討台灣金融業設立海外分支機構的政治經濟區位分析 | 林昌平 | 2017-08~2020-07 | 科技部研究計畫 |
| 106 | 馬來西亞雪蘭莪州巴生的金門社群的移民記憶及生活場域 | 江柏煒 | 2017-08~2018-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 105 | 昔孟母、何處尋？透過調查資料與空間資訊探討家庭教育支出對社會階層流動影響性的時空變遷 | 林昌平 | 2016-08~2017-07 | 科技部研究計畫 |
| 104 | 晚清時期林紓翻譯哈葛德非洲探險小說研究 | 鄭怡庭 | 2015-08~2016-07 | 科技部 |
| 104 | 近代僑鄉社會及其物質文化變遷：福建金門珠山、廣東開平自力村之比較研究 | 江柏煒 | 2014-08~2015-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 104 | 近代菲律賓華僑華人社會文化網絡之變遷：以金門社群為中心 | 江柏煒 | 2015-08~2016-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 103 | 政治(不)正確的國族建構：新、馬、印少數族群的記憶地景 | 張碧君 | 2014-08~2017-07 | 科技部 |
| 102 | 台灣民眾的政治地圖：最大熵模型於個體層次資料的應用 | 林昌平 | 2013-08~2014-07 | 國家科學委員會 |
| 102 | 「散居共同體」的建構與變遷：金門／神戶王氏華僑家族的案例分析 | 江柏煒 | 2013-08~2014-07 | 行政院國家科學委員會專題研究計畫 |
| 102 | CSI 犯罪現場之晚清中國：福爾摩斯偵探小說晚清譯本研究 | 鄭怡庭 | 2013-08~2014-07 | 科技部 |
| 102 | 如何有效預測選舉結果？空間訊息法於選舉領先指標的應用 | 林昌平 | 2013-08~2016-07 | 科技部研究計畫 |
| 102 | 島嶼韌性社區與小島住民環境治理研究--島嶼韌性社區與小島住民環境治理研究：金門與廈門環境治理及城鄉發展政策的比較研究(II) | 江柏煒 | 0013-08~2014-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 101 | 金融自由化與政治民主化的空間模型發展：所得不均的觀點 | 林昌平 | 2012-03~2013-02 | 國家科學委員會 |
| 101 | 華僑跨國網絡的形成及其文化互動：以烈嶼及汶萊為例 | 江柏煒 | 2012-08~2013-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 101 | 島嶼韌性社區與小島住民環境治理研究--金門島海外移居社群對原居社區環境治理之影響(I) | 江柏煒 | 2012-08~2013-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 101 | 比較星、馬動態與靜態的文化再現：從港口城市地景到博物館展覽 | 張碧君 | 2012-08~2014-08 | 科技部 |
| 100 | 金門軍事地景的價值評估及其保存策略：以世界文化遺產概念與標準檢視之 | 江柏煒 | 2011-08~2012-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 99 | 尋找「賽先生」的爸爸：儒勒‧凡爾納的科學小說晚清譯本研究 | 鄭怡庭 | 2010-08~2011-07 | 國科會 |
| 99 | XVIII Biennial Conference of the European Association of Chinese Studies | 鄭怡庭 | 2010-07~2010-07 | 國科會 |
| 99 | “混雜的現代性”：近代金門的華僑影響及其物質文化變遷 | 江柏煒 | 2010-08~2011-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 99 | 新加坡博物館的文化再現 | 張碧君 | 2010-08~2012-07 | 科技部 |
| 98 | 島嶼環境、移民歷史與海外華人社會的建立：以馬來西亞雪蘭莪州浮羅吉膽（Pulau Ketam）的金門人為例 | 江柏煒 | 2009-08~2010-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 97 | 城市發展與海外華人社會變遷：新加坡金門人“駁船業估俚間”之考察 | 江柏煒 | 2008-08~2009-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 96 | 海外僑社與僑鄉社會之關係：以馬來西亞金門人社團為例 | 江柏煒 | 2007-08~2008-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 95 | 身體規訓、性產業與空間：戰地金門的「特約茶室」（八三一）（1954-1990） | 江柏煒 | 2006-08~2007-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 94 | 金門的教育啟蒙與學校建築（1920s-40s）：近代華僑興學之考察 | 江柏煒 | 2005-08~2006-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 92 | 僑鄉金門的近代化歷程：以珠山《顯影》僑刊為史料之考察 | 江柏煒 | 2003-08~2004-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 90 | “洋裝碗帽”的民族形式：陳嘉庚建築論述中的國族主義與文化認同（19010s-1950s） | 江柏煒 | 2001-08~2002-07 | 行政院國家科學及技術委員會 |
| 0 | 《大臺北地區客家庄及客家人原鄉聚落田野調查》 | 潘朝陽 | 2003-08~2003-12 | 臺北市客家事務委員會 |
| 0 | 《臺灣客家風情－大臺北及全國客家庄旅遊景點產業導覽手冊》 | 潘朝陽 | 2003-10~2004-05 | 臺北市客家事務委員會 |
| 0 | 《客家風情－移墾．產業．文化》 | 潘朝陽 | 2004-08~0000-00 | 臺北市：臺北市客委會 |
| 0 | 《人與大地：中華文化圈中的環境實踐》課程講座 | 潘朝陽 | 2004-08~0000-00 | 「人與自然」多媒體通識教學教材規畫案 |
| 0 | 新修桃園縣志．地理志 | 潘朝陽 | 2010-09~0000-00 | 桃園：桃園縣政府 |
| 0 | 《周易》的環境倫理及其大地關係 | 潘朝陽 | 2001-08~2002-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 儒家的自然思想和環境倫理1/3 | 潘朝陽 | 2002-08~2003-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 儒家的自然思想和環境倫理2/3 | 潘朝陽 | 2003-08~2004-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 儒家的自然思想和環境倫理3/3 | 潘朝陽 | 2004-08~2005-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 自然與身體-一個跨文化的論述-在天地之中的安居-儒家的身體空間3/3 | 潘朝陽 | 2007-08~2008-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 自然與身體-一個跨文化的論述-在天地之中的安居-儒家的身體空間2/3 | 潘朝陽 | 2006-08~2007-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 自然與身體-一個跨文化的論述-在天地之中的安居-儒家的身體空間1/3 | 潘朝陽 | 2005-08~2006-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 東亞遺民儒者「想像共同體」的崩壞與重建:朱舜水與洪棄生 | 潘朝陽 | 2008-08~2009-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 儒者在亂離時代的漂泊及其回歸-從孔子到孫夏峰、顧亭林、王船山 | 潘朝陽 | 2009-08~2011-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 經濟利益驅動的政治效果？─探索美國國會對台灣的支持 | | 2011-08~2012-07 | 國科會 |
| 0 | 衝突與合作─ 探索台灣兩岸政策的轉折 (2004 - 2008) | | 2008-01~2009-12 | 國科會 |
| 0 | 兩岸經貿政策對大陸台商投資行為之影響 | | 2009-07~2010-06 | 經濟部科技研究發展專案學研聯合研究計畫 |
| 0 | 古代中國儒家「禮」思想中的環境論與空間性 | 潘朝陽 | 2011-08~2012-07 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 西湖溪谷地客家人文空間的塑成與發展：聚落、文化、族群、產業整合型 研究（一）：西湖溪谷地客家聚落空間結構及宗教神聖空間（一） | 潘朝陽 | 2011-01~2011-12 | 臺北 ：行政院客委會 |
| 0 | 西湖溪谷地客家人文空間的塑成與發展：聚落、文化、族群、產業整合型 研究（二）：西湖溪谷地客家聚落空間結構及宗教神聖空間（二） | 潘朝陽 | 2012-01~2012-12 | 臺北：行政院客委會 |
| 0 | 儒家倫常中的天地之道－當代環境觀與空間論的視域 | 潘朝陽 | 2011-01~2012-03 | 頂大漢學五年期整合研究 |
| 0 | 跨文化的視域：儒家倫常與宗教對話－從古代中國儒家到當代新儒家的宗教觀詮釋 | 潘朝陽 | 2012-04~2012-12 | 頂大漢學五年期整合研究 |
| 0 | 西湖溪谷地客家人文空間的塑成與發展：聚落、文化、族群、產業整合型研究（三）：西湖溪谷地客家聚落空間結構及宗教神聖空間（三） | 潘朝陽 | 2013-01~2013-12 | 臺北：行政院客委會 |
| 0 | 海外華人與移民學術研究群計畫 | 潘朝陽 | 2013-01~2013-12 | 國科會研究計畫案 |
| 0 | 當代新儒家熊十力的儒家式生態空間論 | 潘朝陽 | 2013-08~2014-07 | 國科會研究計畫 |
| 0 | 台灣的選舉與大陸政策：2012年大選的個案研究 | | 2012-08~2014-10 | 國科會 |
| 0 | 總統選舉來臨如何影響對敵國之政策：南韓的個案研究（1987-2012） | | 2014-08~2017-07 | 科技部 |
| 0 | 江戶時代儒佛論諍與融合之內涵及其演變（三年期） | 張崑將 | 2019-08~2021-07 | 科技部 |
